Theo các đơn vị vận tải, trạm BOT này mang danh nghĩa là thu cho tuyến tránh nhưng lại được đặt ngay trên Quốc lộ. Trên thực tế, trạm BOT Cai Lậy được đặt trên tuyến Quốc lộ 1A, cách điểm vào tuyến tránh Cai Lậy khoảng 1km theo hướng Cần Thơ - Tiền Giang.
Đến nay vẫn chưa có lời giải thích về sự bất cập trong việc đặt trạm thu phí ở vị trí này. Tuy nhiên, chỉ sau vài ngày đi vào hoạt động, trạm thu phí này đã bộc lộ các hạn chế. Điều này đã đi ngược với sự kỳ vọng của người tham gia giao thông và làm mất đi ý nghĩa của dự án BOT Cai Lậy - giúp cho các phương tiện giao thông thuận lợi, nhanh chóng và an toàn hơn.