Thu Minh trở thành quán quân của Bước nhảy hoàn vũ 2011. Tuy nhiên, ngay sau đó, tiết mục của cô bị tố là có sự trùng lặp về ý tưởng người thợ săn - con chim, trang phục biểu diễn với bài nhảy của 2 vũ công Bulgaria tiếng thế giới là Max Kozhevnikov và Yulia Zagoruychenko.
Trước scandal này, Nữ hoàng nhạc dance cho hay, cô nảy ra ý tưởng về bài nhảy sau một chuyến đi chơi tại Thảo cầm viên. Các giám khảo là Khánh Thi và Chí Anh đều lên tiếng bênh vực Thu Minh. Họ cho rằng, nếu kết tôi Thu Minh đạo bài nhảy thì quá oan ức cho cô.
Ngày 20/4/2012, Thu Minh biểu diễn trong chương trình Ngàn sao hội tụ tại TPHCM. Cô diện một chiếc áo trắng có những đường cắt xẻ táo bạo và không mặc nội y. Trong lúc trình diễn, nữ ca sĩ vô tình để lộ một phần ngực. Giữa tháng 5/2012, Sở Văn hóa, Thể thao và Du lịch TP.HCM quyết định xử phạt nữ ca sĩ 3,5 triệu đồng.
Sau sự việc, Thu Minh thừa nhận: "Sơ suất của tôi là đã chọn cho mình một trang phục không an toàn để trình diễn chứ không hẳn là phản cảm". Cô cũng cảm thấy tiếc vì luôn giữ mình trong suốt 20 năm làm nghề, giờ lại vướng phải một scandal không đáng có.
Năm 2012, với sự hướng dẫn của Thu Minh, Hương Tràm đăng quang ngôi vị cao nhất của cuộc thi The Voice 2012. Tuy nhiên, sau khi rời cuộc thi, mối quan hệ giữa cả hai đã rạn nứt. Trong một bài phỏng vấn, giọng ca "Đường cong" giận dỗi nói: "Hương Tràm có liên lạc với tôi đâu mà tôi giúp đỡ". Lời nói của Thu Minh khiến giọng ca xứ Nghệ phật ý. Cô chia sẻ một status dài trên trang cá nhân giải thích lý do không gần gũi HLV cũ, trong đó có việc cô không được Thu Minh mời tham gia đêm nhạc riêng. Hương Tràm còn nói thêm, cô không giỏi nịnh nọt để lấy lòng Thu Minh.
Trước phản ứng của học trò cũ, Thu Minh nói rằng: "Im lặng là điều cuối cùng tôi có thể làm cho Hương Tràm". Cô còn tuyên bố: "Trúc Nhân là học trò duy nhất của tôi". Sau này, quán quân The Voice 2012 nhiều lần đánh tiếng xin lỗi Thu Minh nhưng cô vẫn giữ thái độ im lặng và xa cách.
Dù được Thu Minh tuyên bố là "học trò duy nhất" nhưng trong một cuộc trò chuyện với truyền thông, Trúc Nhân lại khẳng định, nữ ca sĩ không dìu dắt anh trong sự nghiệp. Lời tuyên bố này của giọng ca "Bốn chữ lắm" khiến nhiều người bất ngờ.
Giữa lúc khán giả đổ xô vào chỉ trích Trúc Nhân, Thu Minh đã lên tiếng giải nguy cho học trò. Cô chia sẻ trên trang cá nhân: "Thằng Quỷ này! Cái tật thẳng thắn kiểu "đanh đá", thiếu điềm đạm, không bình tĩnh nói hoài không sửa giờ "ôm đầu máu" rồi thấy chưa? Chừa nhé, bớt khùng đi, đồng ý là làm nghệ thuật thì phải thế mới có những phút giây thăng hoa và cá tính riêng biệt để đạt được thành công + giải thuởng như bây giờ, nhưng hưng phấn quá mà không kiểm soát được lời nói của mình thì "lỗ đầu" nhé cưng... Hơn ai hết chị hiểu tình cảm của em dành cho chị và chị vẫn tự hào về em ..."
Vào năm 2014, sau khi Thu Minh được bổ nhiệm vào vị trí Đại sứ bảo vệ động vật hoang dã, một clip ghi lại cảnh cô hồn nhiên chia sẻ việc sử dụng mật gấu bị tung lên mạng. Cô còn khẳng định thường xuyên mang theo mật gấu tươi trong túi xách để chữa trị vết thương.
Trước phản ứng mạnh mẽ của công chúng, Thu Minh cho biết, đoạn clip trên được quay vào năm 2011, khi cô chỉ "quan tâm và có sự hiểu biết hạn hẹp trong phạm vi chuyên môn ca hát của bản thân". Nữ ca sĩ khẳng định: "tôi của ngày hôm nay đã trưởng thành và nhận thức được điều gì đúng sai". Cô cũng cho rằng, đoạn clip trên sẽ làm thức tỉnh những người đang sử dụng mật gấu tươi.
Bên cạnh việc từng sử dụng mật gấu tươi, đại sứ bảo vệ động vật hoang dã Thu Minh còn bị chỉ trích khi sử dụng những chiếc túi đắt tiền làm từ da cá sấu. Đáp lại, nữ ca sĩ cho hay: "Tôi phải trở thành thánh nhân ăn chay hay sống khác những người bình thường khi mà nhu cầu cuộc sống xung quanh tôi từ giày dép, túi xách, cặp, nội thất trong nhà, trong xe đều được sản xuất từ da động vật. Tất cả những sự thật này là hiển nhiên và con người đã chấp nhận xài những nhu yếu phẩm này từ xưa đến nay như là một lẽ thường tình".
Khi mang thai con đầu lòng ở tháng thứ 5, Thu Minh và chồng Tây mua một căn hộ penthouse có giá lên tới 90 tỷ đồng tại một tòa nhà đang trong quá trình xây dựng. Tuy nhiên, tới thời hạn trên hợp đồng, vợ chồng nữ ca sĩ vẫn chưa nhận được nhà. Cặp đôi đã quyết định khởi kiện chủ đầu tư và đòi tiền đền bù. Sau khi lùm xùm trên mặt báo, vụ việc không được nhắc tới nữa. Có thông tin, 2 bên đã chọn cách giải quyết trong im lặng và không công bố với truyền thông. Tuy nhiên, Thu Minh không lên tiếng về tin đồn này.
Mới đây, vợ chồng Thu Minh bị một tài khoản facebook tố cáo nợ các doanh nghiệp gỗ của Việt Nam hàng trăm tỷ đồng và luôn tìm cách từ chối thanh toán. Đáp lại, nữ ca sĩ khẳng định đó là thông tin bịa đặt.
Giữa tâm bão scandal, Thu Minh chia sẻ cảnh tiễn chồng lên máy bay đi công tác tại châu Âu. Trước đó, nữ ca sĩ khẳng định, những lời tố cáo thiếu căn cứ trên không ảnh hưởng tới cuộc sống của vợ chồng cô.
